医疗事故中的民事纠纷的处理方法，主要有有双方当事人协商解决、向卫生行政部门提出调解申请或者向人民起诉。根据《医疗事故处理条例》第四十六条：发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决;不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民提起民事诉讼。
一、医疗事故责任构成
1、医疗机构或其工作人员在主观上必须有过失
2、医疗机构或其工作人员有违法违规行为
3、必须有人身损害的事实发生，且该人身损害应当达到《医疗事故处理条例》确定的损害程度
4、医疗机构及其医务人员的过失行为与人身损害后果必须有因果关系
医疗事故责任纠纷怎么处理的相关法律依据：
《医疗事故处理条例》第四十六条规定，发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决即和解，不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民提起民事诉讼。由此可见，在我国，发生医疗纠纷有三种解决方式，即和解、调解和诉讼。
二、小诊所医疗事故怎么赔偿
小诊所医疗事故的赔偿程序根据实际情况而定。发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决，不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民提起民事诉讼。双方当事人协商解决医疗事故的赔偿等民事责任争议的，应当制作协议书。已确定为医疗事故的，卫生行政部门应医疗事故争议双方当事人请求，可以进行医疗事故赔偿调解。
三、发生医疗事故怎么索赔
发生医疗事故的索赔程序如下。发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决，不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民提起民事诉讼。双方当事人协商解决医疗事故的赔偿等民事责任争议的，应当制作协议书。已确定为医疗事故的，卫生行政部门应医疗事故争议双方当事人请求，可以进行医疗事故赔偿调解。
