利用shell编程，提取注释文件中指定范围内的行

⽬的：

经常需要对信息分析中的结果⽂件进⾏分析，有时可能期望提取指定染⾊体范围内，指定区间内的⽂件。 代码：

#!/bin/bash

echo -e \"\\033[32m\\n地球是圆的，⽽看似像终点的地⽅可能也只是起点。\\n \\033[0m\"

# 如果不指定输⼊结果名称，使⽤默认名称outfile=\"result.\"`date +%Y-%m-%d`

function Site() {

echo -e \"\\033[31m输出结果名称为：$outfile\\033[0m\"

less $infile | awk -F \"\\" 'NR < 2{print $0}NR>1{if($2 == '''$chr''' && $3 > '''$newstart''' && $3 < '''$newend''')print $0}' > $outfile}

function x2t() {

echo -e \"结果⽂件进⾏格式转换：${outfile} ===> ${outfile}.xlsx\"

python /WORK/Disease/lmt/Code/xls2txt/xls2txt.py ${outfile} ${outfile}.xlsx t2x}

while getopts \":i:c:s:e:o:hf\" opt;do case $opt in i)

infile=$OPTARG

echo -e \"\\033[32m输⼊⽂件为：$infile\\033[0m\" ;; c)

chr=$OPTARG

echo -e \"\\033[32m查询的染⾊体为：$chr\\033[0m\" ;; s)

start=$OPTARG

newstart=`expr ${start} - 1`

echo -e \"\\033[32m查询的起始位置为：$start\\033[0m\" ;; e)

end=$OPTARG

newend=`expr ${end} + 1`

echo -e \"\\033[32m查询的终⽌位置为：$end\\033[0m\" ;; o)

outfile=$OPTARG ;; f) ;; h)

echo -e ''' 使⽤帮助： 1)

site -i infile -c chr -s start -e end 2)

site -i infile -c chr -s start -e end -o result # ⾃⼰指定输出结果名称 3)

site -i infile -c chr -s start -e end [-o result] -f # 是否对⽣成的结果⽂件进⾏格式转换 4)

site -o file -f # 对file⽂件进⾏格式转换 ''' esacdone

if [ $infile\"x\" != \"x\" -a $chr\"x\" != \"x\" -a $start\"x\" != \"x\" -a $end\"x\" != \"x\" ]; then echo \"开始提取结果......\" Site

if [[ $f\"x\" == \"x\" ]]; then x2t fi

elif [ -s $outfile -a $f\"x\" == \"x\" ]; then x2t

elif [[ \"$@x\" == \"x\" ]]; then

# echo \"⼩朋友, 你是不是忘记啥啦......\" # echo \"查看帮助： site -h\" site -h fi

中间有个格式转换的代码，如下：

#!/usr/bin/env python#-*- coding:utf-8 -*-import openpyxl

from openpyxl import load_workbook #读取excel⽂件from openpyxl import Workbook # 创建xlsx⽂件

class ChangeType(object): def __init__(self, args):

self.source = args[\"source\"] self.target = args[\"target\"]

def xls2txt(self):

wb = load_workbook(self.source) ws = wb.active

out = open(self.target, 'w') for row in ws.rows: for cell in row:

value = cell.value

out.write(\"{value}\\".format(**locals())) out.write(\"\\n\")

def txt2xls(self): wb = Workbook()

ws = wb.create_sheet(\"Result\", index=0) with open(self.source, 'r') as fr: for line in fr:

linelist = line.strip().split(\"\\") ws.append(linelist) wb.save(self.target)

def main():

demo = ChangeType(args) if args[\"type\"]==\"x2t\": demo.xls2txt()

elif args[\"type\"] == \"t2x\": demo.txt2xls() else:

exit(\"请输⼊想要转换的格式\")

if __name__ == \"__main__\": import argparse

parser = argparse.ArgumentParser()

parser.add_argument(\"source\", help=\"原格式⽂件\")

parser.add_argument(\"target\", help=\"想要转换的格式⽂件\")

parser.add_argument(\"type\", help=\"请输⼊想要转换的格式\", choices=[\"x2t\", \"t2x\"]) args = vars(parser.parse_args()) main()